RNA polymeráza II

Z Multimediaexpo.cz

RNA polymeráza II, zde zachycena v komplexu s alfa-amanitinem, jedem z muchomůrek, jenž na tento enzym působí toxicky[1]

RNA polymeráza II (RNAP II, Pol II) je velmi důležitá eukaryotická RNA polymeráza, někdy prezentovaná jako úplně nejdůležitější.[2] Na základě genetické informace uložené v genech v DNA tato polymeráza umožňuje jejich transkripci, čímž vzniká mRNA. RNA polymeráza II totiž přepisuje všechny geny, které kódují bílkoviny, a většinu genů pro snRNA a miRNA;[3][4] ostatní dvě významné eukaryotické polymerázy (RNAP I a RNAP III) se zaměřují na zbylé RNA geny, z nichž bílkoviny samozřejmě nevznikají.[2]

Stavba

RNA polymeráza II se skládá v nejokleštěnější podobě z 10 podjednotek. Pro iniciaci je však potřeba ještě další, rpb4/7 komplex, a navíc několik transkripčních faktorů. Mezi významné podjednotky patří Rpb1 a Rpb2, které odpovídají bakteriálním beta podjednotkám. Na Rpb1 se nachází unikátní doména CTD obsahující množství repetitivních sekvencí obsahujících aminokyseliny Tyr - Ser - Pro - Thr - Ser - Pro - Ser. Doména CTD prochází na začátku transkripce fosforylací a v jejím průběhu dochází opět k její defosforylaci.[5]

Reference

  1. B. Meinecke and S. Meinecke-Tillmann. Effects of -amanitin on nuclear maturation of porcine oocytes in vitro. Journal of Reproduction and Fertility, 1993, roč. 98, s. 195–201. Dostupné online. DOI:10.1530/jrf.0.0980195. PMID 8345464.  
  2. 2,0 2,1 Molecular Biology Web Book: Chapter 4: Gene Transcription [online]. 2009 Web Books Publishing. Dostupné online.  
  3. Kornberg R. Eukaryotic transcriptional control. Trends in Cell Biology, 1999, roč. 9, s. M46. DOI:10.1016/S0962-8924(99)01679-7. PMID 10611681.  
  4. SIMS, Robert J, Subhrangsu S Mandal, Danny Reinberg Recent highlights of RNA-polymerase-II-mediated transcription. Current Opinion in Cell Biology, 2004-06, roč. 16, čís. 3, s. 263-271. Dostupné online [cit. 2009-09-30]. ISSN 0955-0674. DOI:10.1016/j.ceb.2004.04.004.  
  5. Patrick Cramer. ENCYCLOPEDIA OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, FOUR-VOLUME SET, 1-4. Příprava vydání Lennarz,W.J., Lane, M.D.. [s.l.] : [s.n.]. Kapitola RNA Polymerase II Structure in Eukaryotes.